第1期終盤から1か月後。体の修復を待ちながら、以前と同じ二心同体の生活を続ける学生のつとむと捜査官のバーディー。有田しおんとしての活動も含め、忙しい日々が続く。前と違うのは、壊滅した街と被害を受けた人々が現実に存在することだった。脱走したリュンカ事件の首謀者達を捕えるべくバーディーは奔走するが、思わぬ人物と遭遇することになる。それはバーディーの幼馴染で、地球人として生活しているナタルだった……。
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tvk等／土24:30〜25:00／10.04.03〜09.09.25／30分
主題歌：OP／吉岡亜衣加「十六夜涙」
声優：桑島法子、三木眞一郎、森久保祥太郎、鳥海浩輔、吉野裕行、遊佐浩二、大川透
低迷を続けるETU（East Tokyo United）に一人の男が監督として迎えられた。男の名は達海猛。かつてのETUのスター選手であり、引退後はイングランド5部のアマチュアクラブの監督としてFAカップでベスト32に導きプレミアリーグのクラブをギリギリまで追い詰めた人物である。そんな彼に古巣のクラブが白羽の矢を立てた訳だがチーム内は開幕前から騒動ばかり、果たしてこの起用は吉と出るか凶と出るか。
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BS hi等／日9:25〜9:50／10.04.04〜／30分
主題歌：OP／THE CHERRY COKE$「My story 〜まだ見ぬ明日へ〜」
声優：関智一、水島大宙、置鮎龍太郎、小野大輔、川島得愛、浅野真澄
高校3年生の少年・阿良々木暦は、文化祭の準備をしていた5月のある日、ひょんな事から2年間ろくに話したことのないクラスメイト・戦場ヶ原ひたぎの秘密を知ってしまう。ひたぎは体育の時間には全く参加せず、通院を続けているのだが、実は彼女には体重が殆ど無かったのである。暦は秘密を知った日の放課後、ひたぎから秘密をばらさないようにと執拗な脅しを受けるが、それにもめげず彼女の秘密に対する協力を申し出る。彼女によると、2年前に1匹の不思議な蟹に出会い、重さをそっくり持っていかれたのだと言う。
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TOKYO MX等／金23:00〜23:30／09.07.03〜09.09.25／30分
主題歌：OP／supercell「君の知らない物語」
声優：神谷浩史、斎藤千和、加藤英美里、沢城みゆき、花澤香菜、堀江由衣、櫻井孝宏
第1期終盤から1か月後。体の修復を待ちながら、以前と同じ二心同体の生活を続ける学生のつとむと捜査官のバーディー。有田しおんとしての活動も含め、忙しい日々が続く。前と違うのは、壊滅した街と被害を受けた人々が現実に存在することだった。脱走したリュンカ事件の首謀者達を捕えるべくバーディーは奔走するが、思わぬ人物と遭遇することになる。それはバーディーの幼馴染で、地球人として生活しているナタルだった……。
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テレ玉等／金25:00〜25:30／09.01.16〜／30分
主題歌：OP／ニルギリス 「kiseki」
ED／ノースリーブス「タネ」
声優：千葉紗子、入野自由、伊藤かな恵、藤原啓治、坂本真綾、鈴村健一、名塚佳織
謎の古代兵器「リュンカ」の強奪犯を追って未開の惑星、地球にやってきた連邦警察のアルタ人女性捜査官バーディー・シフォン=アルティラは、犯人を探し出すためグラビアアイドル有田しおんとして活動していた。そしてついに犯人を探し出すが、追いつめる中で誤って地球人の高校生千川つとむを殺してしまう。地球よりも進んだ連邦の技術を使ってつとむの体は修復されることとなるが修復には時間が必要であり、その間の措置としてつとむの意識はバーディーの体に移され、バーディーとつとむは1つの体に2人の意識が存在する「二心同体」となる。その後なんとか犯人を倒したバーディーであったが、その代償として長年のバディ（相棒）であったロボットのテュートを失い、リュンカの手がかりも失う。
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テレ玉等／金25:00〜25:30分／08.07.04〜08.09.26／30分／13回
主題歌：OP／Hearts Grow 「そら」
ED／アフロマニア「Let's go together」
声優：千葉紗子、入野自由、伊藤かな恵、藤原啓治、坂本真綾、鈴村健一、名塚佳織
海賊となった少年モンキー・D・ルフィが、仲間を集めながら海を渡り海賊王を目指す海洋冒険ロマン。
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フジテレビ他／日9:30〜10:00／09.10.08〜／30分／
主題歌：OP(第395話〜第425話)／東方神起「Share The World」
OP(第426話〜)／矢口真里とストローハット「風をさがして」
声優：田中真弓、中井和哉、山口勝平、岡村明美、平田広明、大谷育江、山口由里子
海賊となった少年モンキー・D・ルフィが、仲間を集めながら海を渡り海賊王を目指す海洋冒険ロマン。
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フジテレビ他／日9:30〜10:00／09.07.05〜09.10.11／30分／13回
主題歌：OP(第395話〜第425話)／東方神起「Share The World」
声優：田中真弓、中井和哉、山口勝平、岡村明美、平田広明、大谷育江、山口由里子
